即便实用性突出，保健品塑料瓶仍存在明显短板。部分材质耐热性不足，遇高温易变形，无法用于需低温冷藏以外的特殊储存场景，且阻隔性弱于玻璃，对高活性、易挥发的保健品，长期存放可能影响其功效。此外，环保问题较为突出，废弃塑料瓶若处理不当易造成污染，虽可回收，但部分回收料纯度不足，无法满足保健品包装的安全要求，限制了回收利用率。

总体来看，保健品塑料瓶的优势契合日常保健场景需求，短板可通过技术升级改变。如今环保塑料、高阻隔材质的研发应用，既保留了其轻便便捷的特点，又强化了安全性和环保性。未来，保健品塑料瓶将朝着安全化、环保化、多功能化方向发展，较好地适配保健品的储存和使用需求。